Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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COL4A6Q14031 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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COL4A6Q14031 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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COL4A6Q14031 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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COL4A6Q14031 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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COL4A6Q14031 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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COL4A6Q14031 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
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COL4A6Q14031 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
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COL4A6Q14031 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COL4A6Q14031 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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