Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IRF5Q13568 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
IRF5Q13568 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms