Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TCIRG1Q13488 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCIRG1Q13488 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
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