Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
AP3B2Q13367 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms