Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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NR1H3Q13133 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
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NR1H3Q13133 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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NR1H3Q13133 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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NR1H3Q13133 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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NR1H3Q13133 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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NR1H3Q13133 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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NR1H3Q13133 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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NR1H3Q13133 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
NR1H3Q13133 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
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