Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAM27E3Q08E93 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FAM27E3Q08E93 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms