Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
POLEQ07864 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLEQ07864 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLEQ07864 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms