Protein–RNA interactions for Protein: Q07654

TFF3, Trefoil factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 80 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFF3Q07654 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TFF3Q07654 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TFF3Q07654 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms