Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CXCL9Q07325 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CXCL9Q07325 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms