Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
TOP2BQ02880 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TOP2BQ02880 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms