Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
MAT1AQ00266 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
MAT1AQ00266 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms