Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FBXW4P57775 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms