Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GFRA1P56159 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms