Protein–RNA interactions for Protein: P52798

EFNA4, Ephrin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA4P52798 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
EFNA4P52798 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EFNA4P52798 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms