Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCR4P51679 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCR4P51679 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCR4P51679 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCR4P51679 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCR4P51679 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCR4P51679 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCR4P51679 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCR4P51679 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCR4P51679 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCR4P51679 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCR4P51679 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCR4P51679 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCR4P51679 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCR4P51679 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCR4P51679 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCR4P51679 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCR4P51679 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCR4P51679 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCR4P51679 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCR4P51679 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms