Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
DCCP43146 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCCP43146 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCCP43146 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCCP43146 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCCP43146 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCCP43146 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCCP43146 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCCP43146 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCCP43146 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
DCCP43146 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCCP43146 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCCP43146 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
DCCP43146 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCCP43146 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCCP43146 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCCP43146 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCCP43146 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCCP43146 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
DCCP43146 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
DCCP43146 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
DCCP43146 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
DCCP43146 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
DCCP43146 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCCP43146 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCCP43146 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCCP43146 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCCP43146 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCCP43146 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCCP43146 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCCP43146 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCCP43146 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCCP43146 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCCP43146 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCCP43146 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCCP43146 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCCP43146 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
DCCP43146 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCCP43146 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCCP43146 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCCP43146 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCCP43146 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCCP43146 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
DCCP43146 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms