Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MLH1P40692 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MLH1P40692 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MLH1P40692 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MLH1P40692 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms