Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXA13P31271 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA13P31271 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HOXA13P31271 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA13P31271 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA13P31271 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA13P31271 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA13P31271 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA13P31271 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA13P31271 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA13P31271 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXA13P31271 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXA13P31271 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXA13P31271 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms