Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TM4SF1P30408 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TM4SF1P30408 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms