Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARID4AP29374 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARID4AP29374 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms