Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DNMT1P26358 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28■■■□□ 2.07
DNMT1P26358 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms