Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB3BP20337 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms