Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
TOP2AP11388 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
TOP2AP11388 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms