Protein–RNA interactions for Protein: P10070

GLI2, Zinc finger protein GLI2, humanhuman

Predictions only

Length 1,586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI2P10070 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI2P10070 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI2P10070 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI2P10070 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI2P10070 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
GLI2P10070 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
GLI2P10070 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
GLI2P10070 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
GLI2P10070 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
GLI2P10070 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI2P10070 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI2P10070 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI2P10070 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI2P10070 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI2P10070 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI2P10070 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI2P10070 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI2P10070 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI2P10070 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
GLI2P10070 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
GLI2P10070 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GLI2P10070 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI2P10070 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI2P10070 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI2P10070 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
GLI2P10070 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms