Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
RGPD1P0DJD0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGPD1P0DJD0 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms