Protein–RNA interactions for Protein: P09327

VIL1, Villin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VIL1P09327 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VIL1P09327 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIL1P09327 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIL1P09327 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIL1P09327 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VIL1P09327 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIL1P09327 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIL1P09327 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIL1P09327 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIL1P09327 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIL1P09327 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIL1P09327 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIL1P09327 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIL1P09327 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VIL1P09327 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VIL1P09327 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VIL1P09327 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VIL1P09327 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms