Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ITGB3P05106 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms