Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RAPGEF3O95398 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RAPGEF3O95398 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms