Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GABARAPO95166 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GABARAPO95166 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms