Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ECM2O94769 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ECM2O94769 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ECM2O94769 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECM2O94769 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECM2O94769 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECM2O94769 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECM2O94769 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ECM2O94769 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ECM2O94769 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms