Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNKO75909 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNKO75909 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNKO75909 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNKO75909 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNKO75909 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNKO75909 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNKO75909 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNKO75909 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNKO75909 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNKO75909 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNKO75909 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNKO75909 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCNKO75909 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNKO75909 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNKO75909 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNKO75909 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNKO75909 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNKO75909 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCNKO75909 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCNKO75909 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCNKO75909 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms