Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ATG13O75143 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG13O75143 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG13O75143 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG13O75143 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG13O75143 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG13O75143 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ATG13O75143 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ATG13O75143 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ATG13O75143 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ATG13O75143 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG13O75143 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG13O75143 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG13O75143 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG13O75143 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG13O75143 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG13O75143 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG13O75143 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG13O75143 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG13O75143 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG13O75143 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG13O75143 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG13O75143 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ATG13O75143 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms