Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DHX16O60231 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX16O60231 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX16O60231 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX16O60231 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX16O60231 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX16O60231 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX16O60231 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DHX16O60231 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX16O60231 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX16O60231 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX16O60231 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX16O60231 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX16O60231 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX16O60231 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX16O60231 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX16O60231 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX16O60231 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX16O60231 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DHX16O60231 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DHX16O60231 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DHX16O60231 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DHX16O60231 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms