Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
UBDO15205 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
UBDO15205 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
UBDO15205 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBDO15205 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBDO15205 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
UBDO15205 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
UBDO15205 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBDO15205 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms