Protein–RNA interactions for Protein: J3QW42

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QW42 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QW42 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QW42 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QW42 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
J3QW42 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
J3QW42 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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