Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNF839A8K0R7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ZNF839A8K0R7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms