Protein–RNA interactions for Protein: A6NCI4

VWA3A, von Willebrand factor A domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3AA6NCI4 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
VWA3AA6NCI4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms