Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRAMEF22A3QJZ6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PRAMEF22A3QJZ6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms