Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G9

PCDHGA4, Protocadherin gamma-A4, humanhuman

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA4Q9Y5G9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHGA4Q9Y5G9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHGA4Q9Y5G9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PCDHGA4Q9Y5G9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PCDHGA4Q9Y5G9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PCDHGA4Q9Y5G9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PCDHGA4Q9Y5G9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms