Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.771e-6■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.481e-6■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.131e-6■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 TNIP2-207ENST00000511352 572 ntTSL 321.76■■□□□ 1.071e-6■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 TNIP2-205ENST00000507686 540 ntTSL 49.5□□□□□ -0.891e-6■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.428e-7■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 AATK-AS1-202ENST00000571031 1488 ntTSL 1 (best)22.11■■□□□ 1.138e-8■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 AATK-AS1-201ENST00000414089 1577 ntTSL 220.75■□□□□ 0.918e-8■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.918e-8■■■■■ 38.7
FAM120AQ9NZB2 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-9■■■■■ 38.6
FAM120AQ9NZB2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.632e-7■■■■■ 38.5
FAM120AQ9NZB2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.242e-7■■■■■ 38.5
FAM120AQ9NZB2 FOXRED1-214ENST00000532590 674 ntTSL 26.79□□□□□ -1.322e-9■■■■■ 38.5
FAM120AQ9NZB2 CHFR-214ENST00000536932 584 ntTSL 416.71■□□□□ 0.271e-6■■■■■ 38.5
FAM120AQ9NZB2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.881e-10■■■■■ 38.4
FAM120AQ9NZB2 ERMP1-206ENST00000489219 3293 ntTSL 1 (best)19.03■□□□□ 0.642e-20■■■■■ 38.4
FAM120AQ9NZB2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.023e-8■■■■■ 38.4
FAM120AQ9NZB2 FBXL19-209ENST00000566320 546 ntTSL 518.35■□□□□ 0.533e-8■■■■■ 38.4
FAM120AQ9NZB2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.995e-7■■■■■ 38.3
FAM120AQ9NZB2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.745e-7■■■■■ 38.3
FAM120AQ9NZB2 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 38.3
FAM120AQ9NZB2 TRIP12-207ENST00000428959 584 ntTSL 39.15□□□□□ -0.942e-7■■■■■ 38.3
FAM120AQ9NZB2 KCNIP2-213ENST00000483385 736 ntTSL 319.87■□□□□ 0.773e-7■■■■■ 38.2
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP12-203ENST00000375245 4958 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.342e-7■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP12-205ENST00000396144 5084 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP12-202ENST00000344936 4128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.582e-7■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 ARHGAP12-204ENST00000375250 4914 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.12e-7■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 PTPRS-206ENST00000588552 5443 ntTSL 1 (best)16.33■□□□□ 0.215e-12■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.254e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 MYH9-210ENST00000486218 788 ntTSL 321.02■□□□□ 0.964e-11■■■■■ 38.1
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FAM120AQ9NZB2 EXT2-209ENST00000532479 580 ntTSL 420.16■□□□□ 0.824e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 TERT-203ENST00000460137 2992 ntTSL 1 (best)20.03■□□□□ 0.84e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.534e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.484e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 TERT-204ENST00000484238 2422 ntTSL 517.63■□□□□ 0.414e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 MYH9-208ENST00000475726 768 ntTSL 317.36■□□□□ 0.374e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.324e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.134e-11■■■■■ 38.1
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FAM120AQ9NZB2 EXT2-201ENST00000343631 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.44e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 ELMO2-209ENST00000462491 938 ntTSL 211.2□□□□□ -0.624e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 EXT2-203ENST00000395673 3454 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.634e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 FAM222A-AS1-203ENST00000541723 871 ntTSL 211.08□□□□□ -0.644e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 ELMO2-202ENST00000352077 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.934e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 ELMO2-215ENST00000481852 717 ntTSL 46.13□□□□□ -1.434e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.54e-11■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 KCNIP2-209ENST00000434163 534 ntTSL 1 (best)10.43□□□□□ -0.746e-7■■■■■ 38.1
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FAM120AQ9NZB2 C11orf24-202ENST00000527280 533 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.43■□□□□ 0.544e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.284e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 NCAPG2-201ENST00000356309 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 38.1
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FAM120AQ9NZB2 NCAPG2-204ENST00000432615 4134 ntTSL 59□□□□□ -0.973e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 NCAPG2-206ENST00000467785 3276 ntTSL 1 (best)8.6□□□□□ -1.033e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.313e-8■■■■■ 38.1
FAM120AQ9NZB2 AL138756.1-201ENST00000563434 4488 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.067e-10■■■■■ 38
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FAM120AQ9NZB2 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.096e-7■■■■■ 37.8
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FAM120AQ9NZB2 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 520.4■□□□□ 0.866e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-207ENST00000444776 594 ntTSL 419.21■□□□□ 0.676e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.616e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 518.51■□□□□ 0.556e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.356e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 510.97□□□□□ -0.656e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 39.41□□□□□ -0.96e-7■■■■■ 37.8
FAM120AQ9NZB2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.539e-8■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 RGS12-205ENST00000502947 2237 ntTSL 1 (best)21.03■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 MAEA-204ENST00000503162 2069 ntTSL 217.46■□□□□ 0.392e-10■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 MAEA-220ENST00000515766 3136 ntTSL 217.08■□□□□ 0.322e-10■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.681e-6■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 LINC01237-205ENST00000457686 586 ntTSL 416.1■□□□□ 0.171e-6■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 LINC01237-202ENST00000429947 470 ntTSL 414.89□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.797e-7■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 222.38■■□□□ 1.171e-15■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.215e-15■■■■■ 37.7
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 526.18■■□□□ 1.784e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 222.71■■□□□ 1.234e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)22.32■■□□□ 1.164e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.964e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 220.64■□□□□ 0.894e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.514e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 217.87■□□□□ 0.454e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 417.46■□□□□ 0.394e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 515.1■□□□□ 0.014e-12■■■■■ 37.6
FAM120AQ9NZB2 AC091959.3-201ENST00000506502 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.365e-8■■■■■ 37.5
FAM120AQ9NZB2 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.725e-8■■■■■ 37.5
FAM120AQ9NZB2 C21orf58-208ENST00000472607 713 ntTSL 315.89■□□□□ 0.138e-24■■■■■ 37.5
FAM120AQ9NZB2 GPR108-211ENST00000597706 1834 ntTSL 521.99■■□□□ 1.114e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.044e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 GPR108-208ENST00000595908 1750 ntTSL 518.68■□□□□ 0.584e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.354e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 GPR108-213ENST00000598626 619 ntTSL 317.2■□□□□ 0.344e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 GPR108-203ENST00000537722 619 ntTSL 1 (best)16.65■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 GPR108-205ENST00000594500 523 ntTSL 316.65■□□□□ 0.264e-7■■■■■ 37.4
FAM120AQ9NZB2 GPR108-204ENST00000594034 778 ntTSL 312.89□□□□□ -0.354e-7■■■■■ 37.4
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