Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BCAS3Q9H6U6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BCAS3Q9H6U6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
BCAS3Q9H6U6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BCAS3Q9H6U6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BCAS3Q9H6U6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms