Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hipk3Q9ERH7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hipk3Q9ERH7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hipk3Q9ERH7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hipk3Q9ERH7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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