Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
4933402E13RikQ9D4D2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
4933402E13RikQ9D4D2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
4933402E13RikQ9D4D2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
4933402E13RikQ9D4D2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
4933402E13RikQ9D4D2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
4933402E13RikQ9D4D2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms