Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT5

Nop16, Nucleolar protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop16Q9CPT5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nop16Q9CPT5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nop16Q9CPT5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nop16Q9CPT5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nop16Q9CPT5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nop16Q9CPT5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nop16Q9CPT5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nop16Q9CPT5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nop16Q9CPT5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop16Q9CPT5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop16Q9CPT5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop16Q9CPT5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop16Q9CPT5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nop16Q9CPT5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.1 ms