Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NSD3Q9BZ95 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NSD3Q9BZ95 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
NSD3Q9BZ95 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
NSD3Q9BZ95 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NSD3Q9BZ95 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NSD3Q9BZ95 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms