Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
LYSTQ99698 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
LYSTQ99698 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LYSTQ99698 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms