Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX8

RTP4, Receptor-transporting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP4Q96DX8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
RTP4Q96DX8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RTP4Q96DX8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RTP4Q96DX8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RTP4Q96DX8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms