Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC117Q8IWD4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC117Q8IWD4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC117Q8IWD4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC117Q8IWD4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms