Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC80Q76M96 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CCDC80Q76M96 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CCDC80Q76M96 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC80Q76M96 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms