Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQA6

Igsf3, Immunoglobulin superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf3Q6ZQA6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Igsf3Q6ZQA6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Igsf3Q6ZQA6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Igsf3Q6ZQA6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Igsf3Q6ZQA6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Igsf3Q6ZQA6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms